Hiruzen Sarutobi

Hiruzen Sarutobi  , o Terceiro Hokage  , foi o Hokage que comandou a vila por mais tempo, tendo assumido o cargo por duas vezes distintas. Hiruzen era pai de Asuma e deixou a posição de Hokage para Minato Namikaze, mas depois da morte deste, ele voltou ao cargo. Antes de ser Hokage, ele era o líder do Time Sarutobi, e tinha como alunos Jiraiya,Orochimaru e Tsunade. Como Orochimaru planejava destruir Konoha, ele se sacrificou para pará-lo. Como já estava velho e sabia que não podia vencê-lo, ele selou sua alma junto com os braços de Orochimaru. Depois de sua morte, sua aluna Tsunade foi a escolhida para ser Hokage.

Tsunade Senju

Tsunade  é a Quinta Grande Hokage, uma ex-aluna de Hiruzen Sarutobi, o Terceiro Grande Hokage e ex-companheira de equipe de Jiraiya e Orochimaru. Tsunade é neta de Hashirama Senju, o Primeiro Grande Hokage, e ganhou o título de Hokage, depois da morte de seu Sensei. Sua única aluna no início da série era Shizune, mas depois ela começa a treinar Sakura Haruno. Dona de uma grande força, Tsunade é considerada a melhor ninja médica da história. 

Jiraiya

Jiraiya   era um ninja de Konoha e um dos professores de Naruto, e é especializado em doton e katon. Kishimoto comentou que, de todas as relações mestre-aluno que ele criou em Naruto, o vínculo entre Naruto e Jiraiya é o seu favorito, dizendo que por isso desenhá-los "vale a pena" . Enquanto criança, Jiraiya esteve sob a tutela do Sandaime Hokage, juntamente de seus companheiros de time, Tsunade Senju e Orochimaru.  Jiraiya é conhecido no mundo de Naruto como o "Sábio dos Sapos"   devido a seus jutsu relacionado a sapos. Jiraiya foi o sensei do Yondaime Hokage, e durante a Segunda Guerra Shinobi, ele foi o líder do segundo Time Jiraiya, quando treinava Konan, Yahiko e Nagato, que mais tarde viria a fundar a organização criminosa Akatsuki. Apesar de permanecer afiliado à Vila Oculta da Folha, ele passa a maior parte de seu tempo viajando. A personalidade de Jiraiya é abertamente libertina, e ele orgulhosamente se descreve como o "super pervertido", sendo autor de uma série best-seller de romances adultos.  Durante a Parte I, ele aceita Naruto como seu discípulo, e só volta com ele à Vila da Folha na Parte II, pois começa a vigiar os movimentos da organização criminosa Akatsuki, sem saber que Nagato a havia fundado. Jiraiya passou a vida toda treinando ninjas poderosos, para que um dia a profecia do sábio sapo de Myoboku se realize: Jiraiya teria um discípulo que revolucionaria o mundo shinobi. Inicialmente ele achou que esse discípulo seria Nagato, mas depois que ele volta à Konoha, ele recebe a notícia de que eles haviam morrido. Depois, Jiraiya passa a tarefa de mudar o mundo ninja a Naruto. Jiraiya tem um incrível dom para treinar guerreiros. Entre seus alunos, estão ninjas muito poderosos, tais como Minato, que se tornou o Yondaime Hokage; Yahiko, o fundador da Akatsuki; Nagato, portador do Rinnegan, e posteriormente, responsável por sua morte; e Naruto, o protagonista da série, e o garoto da profecia. Quando Jiraiya encontra Naruto, ele é um garoto sem muito talento, mas Jiraiya o torna forte o suficiente para sucedê-lo como segundo sábio do sapo. Posteriormente Jiraiya vai pessoalmente para Ame enfrentar o líder da Akatsuki. Ele se depara com seu aluno Nagato, que segundo Konan, tinha poder sobre a vida e a morte, e uma capacidade extraordinária de manipular almas. Jiraiya se depara com o jutsu absoluto de Pain, o Pein Rikudou, jutsu que faz o usuário controlar até seis corpos distintos, cada um com uma técnica extraordinária única. Mostrando o Modo Sennin, Jiraiya derrota três deles (os caminhos humano, animal e preta). No entanto, Jiraiya desconhecia o caminho naraka, portanto, não sabia que o mesmo podia reviver os pains mortos. Com todos os pains repostos Jiraiya enfrenta os seis de uma vez só, sendo muito ferido obrigado a recorrer a um jutsu de barreira. Jiraiya ainda prende um deles na barreira, o caminho animal, o mais problemático, segundo ele, já que ele não viu as habilidades do caminho asura e do caminho deva. Jiraiya o enviou a Konoha, e resolveu sair mais uma vez da barreira, mesmo sabendo que isso lhe traria a morte. Ao sair ele descobriu o segredo por trás da técnica de Pain, logo descobrindo que Nagato estava por trás de tudo. Até mesmo Nagato reconheceu que se Jiraiya soubesse de seu segredo, não teria chances contra seu mestre. Quando finalmente Jiraiya descobriu a verdadeira identidade de Pain, Foi impedido de falar, pois o caminho asura esmagou-lhe a garganta. Jiraiya morreu honrosamente numa dura batalha contra seu ex-discípulo, e mesmo assim, conseguiu passar uma mensagem codificada para Konoha, nas costas de Fukasaku. 

Orochimau

Orochimaru  é um ninja criminoso e um dos principais antagonistas da série. Ele é um antigo ninja de Konoha  e também ex-aluno do Sandaime Hokage. Durante a época em que viveu na aldeia, destacou-se como um dos mais fortes ninjas ao lado de seus companheiros de equipe, Jiraiya e Tsunade. Seu desejo de se tornar imortal fez com que ele conduzisse experimentos em outros ninjas de sua vila e mais tarde fugisse da aldeia e se juntasse a organização criminosa conhecida como Akatsuki. Após tentar matar seu companheiro Itachi Uchiha(que o derrota), ele deixa a Akatsuki e cria sua própria aldeia ninja, a Vila Oculta do Som, na esperança de destruir a sua antiga aldeia Sua técnica de imortalidade envolve transferir sua consciência para diferentes corpos. Seu desejo de conseguir um novo hospedeiro (cuja preferência recai sobre Sasuke) é uma de suas motivações durante toda a série. Para enfatizar seu papel como vilão, Kishimoto trabalhou para fazê-lo parecer "pálido e doentio", pois ele achava que isso ajudaria a distinguir os vilões dos protagonistas.